Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ctdp1Q7TSG2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ctdp1Q7TSG2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctdp1Q7TSG2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctdp1Q7TSG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctdp1Q7TSG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctdp1Q7TSG2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctdp1Q7TSG2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.5 ms