Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ48

Srl, Sarcalumenin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrlQ7TQ48 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SrlQ7TQ48 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SrlQ7TQ48 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SrlQ7TQ48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SrlQ7TQ48 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SrlQ7TQ48 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SrlQ7TQ48 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SrlQ7TQ48 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms