Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Znf250Q7TNU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Znf250Q7TNU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Znf250Q7TNU6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Znf250Q7TNU6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Znf250Q7TNU6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf250Q7TNU6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms