Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smap2Q7TN29 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smap2Q7TN29 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Smap2Q7TN29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Smap2Q7TN29 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Smap2Q7TN29 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Smap2Q7TN29 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms