Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp17leQ7M764 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp17leQ7M764 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp17leQ7M764 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp17leQ7M764 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Usp17leQ7M764 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Usp17leQ7M764 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17leQ7M764 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17leQ7M764 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17leQ7M764 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms