Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Eci3Q78JN3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Eci3Q78JN3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Eci3Q78JN3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eci3Q78JN3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Eci3Q78JN3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eci3Q78JN3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms