Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Topbp1Q6ZQF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35,51■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Topbp1Q6ZQF0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Topbp1Q6ZQF0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,37■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Topbp1Q6ZQF0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35,31■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Topbp1Q6ZQF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,26■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,25■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Topbp1Q6ZQF0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35,19■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35,17■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC35,14■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,22
Topbp1Q6ZQF0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,13■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35,11■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35,11■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35,09■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35,08■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35,07■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35,07■■■■□ 3,21
Topbp1Q6ZQF0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35,04■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC35,03■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35,01■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35,01■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Topbp1Q6ZQF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Topbp1Q6ZQF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms