Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
March6Q6ZQ89 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
March6Q6ZQ89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
March6Q6ZQ89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
March6Q6ZQ89 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
March6Q6ZQ89 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
March6Q6ZQ89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
March6Q6ZQ89 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
March6Q6ZQ89 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms