Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Larp1Q6ZQ58 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Larp1Q6ZQ58 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Larp1Q6ZQ58 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Larp1Q6ZQ58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Larp1Q6ZQ58 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Larp1Q6ZQ58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Larp1Q6ZQ58 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Larp1Q6ZQ58 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Larp1Q6ZQ58 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms