Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smpd4Q6ZPR5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Smpd4Q6ZPR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smpd4Q6ZPR5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smpd4Q6ZPR5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smpd4Q6ZPR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms