Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Glis3Q6XP49 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Glis3Q6XP49 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Glis3Q6XP49 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Glis3Q6XP49 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Glis3Q6XP49 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Glis3Q6XP49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Glis3Q6XP49 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Glis3Q6XP49 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Glis3Q6XP49 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms