Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Scgb2b2Q6UGQ3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scgb2b2Q6UGQ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Scgb2b2Q6UGQ3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Scgb2b2Q6UGQ3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Scgb2b2Q6UGQ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms