Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shc4Q6S5L9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shc4Q6S5L9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Shc4Q6S5L9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shc4Q6S5L9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Shc4Q6S5L9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Shc4Q6S5L9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms