Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip4Q6PHZ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kcnip4Q6PHZ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip4Q6PHZ8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Kcnip4Q6PHZ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms