Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ2

Camk2d, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2dQ6PHZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Camk2dQ6PHZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Camk2dQ6PHZ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Camk2dQ6PHZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Camk2dQ6PHZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Camk2dQ6PHZ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Camk2dQ6PHZ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2dQ6PHZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.32■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2dQ6PHZ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2dQ6PHZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Camk2dQ6PHZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms