Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RimklaQ6PFX8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RimklaQ6PFX8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RimklaQ6PFX8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RimklaQ6PFX8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RimklaQ6PFX8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RimklaQ6PFX8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms