Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pik3c3Q6PF93 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pik3c3Q6PF93 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pik3c3Q6PF93 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pik3c3Q6PF93 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pik3c3Q6PF93 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pik3c3Q6PF93 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms