Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtifQ6PEE2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CtifQ6PEE2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CtifQ6PEE2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CtifQ6PEE2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CtifQ6PEE2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CtifQ6PEE2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms