Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Dhx40Q6PE54 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dhx40Q6PE54 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Dhx40Q6PE54 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dhx40Q6PE54 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dhx40Q6PE54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dhx40Q6PE54 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dhx40Q6PE54 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms