Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bfsp2Q6NVD9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Bfsp2Q6NVD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bfsp2Q6NVD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bfsp2Q6NVD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Bfsp2Q6NVD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bfsp2Q6NVD9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bfsp2Q6NVD9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bfsp2Q6NVD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms