Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fbxo41Q6NS60 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Fbxo41Q6NS60 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fbxo41Q6NS60 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fbxo41Q6NS60 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fbxo41Q6NS60 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fbxo41Q6NS60 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Fbxo41Q6NS60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fbxo41Q6NS60 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fbxo41Q6NS60 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fbxo41Q6NS60 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fbxo41Q6NS60 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fbxo41Q6NS60 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fbxo41Q6NS60 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fbxo41Q6NS60 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fbxo41Q6NS60 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms