Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Med13lQ6JPI3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med13lQ6JPI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med13lQ6JPI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Med13lQ6JPI3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Med13lQ6JPI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Med13lQ6JPI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Med13lQ6JPI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms