Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KdsrQ6GV12 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KdsrQ6GV12 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KdsrQ6GV12 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KdsrQ6GV12 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KdsrQ6GV12 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KdsrQ6GV12 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KdsrQ6GV12 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms