Protein–RNA interactions for Protein: Q6GSS7

Hist2h2aa1, Histone H2A type 2-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hist2h2aa1Q6GSS7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hist2h2aa1Q6GSS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hist2h2aa1Q6GSS7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hist2h2aa1Q6GSS7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hist2h2aa1Q6GSS7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms