Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Carmil1Q6EDY6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Carmil1Q6EDY6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Carmil1Q6EDY6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Carmil1Q6EDY6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Carmil1Q6EDY6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Carmil1Q6EDY6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Carmil1Q6EDY6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Carmil1Q6EDY6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Carmil1Q6EDY6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Carmil1Q6EDY6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Carmil1Q6EDY6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Carmil1Q6EDY6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Carmil1Q6EDY6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Carmil1Q6EDY6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
Carmil1Q6EDY6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Carmil1Q6EDY6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms