Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fndc3c1Q6DFV6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc3c1Q6DFV6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc3c1Q6DFV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fndc3c1Q6DFV6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc3c1Q6DFV6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fndc3c1Q6DFV6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fndc3c1Q6DFV6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fndc3c1Q6DFV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fndc3c1Q6DFV6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fndc3c1Q6DFV6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc3c1Q6DFV6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc3c1Q6DFV6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms