Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn1Q6A0D4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rftn1Q6A0D4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rftn1Q6A0D4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rftn1Q6A0D4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rftn1Q6A0D4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rftn1Q6A0D4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rftn1Q6A0D4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rftn1Q6A0D4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rftn1Q6A0D4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms