Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZX8

Ablim3, Actin-binding LIM protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ablim3Q69ZX8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ablim3Q69ZX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ablim3Q69ZX8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ablim3Q69ZX8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ablim3Q69ZX8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ablim3Q69ZX8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ablim3Q69ZX8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ablim3Q69ZX8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms