Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Fan1Q69ZT1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fan1Q69ZT1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fan1Q69ZT1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fan1Q69ZT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Fan1Q69ZT1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Fan1Q69ZT1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fan1Q69ZT1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fan1Q69ZT1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Fan1Q69ZT1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fan1Q69ZT1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fan1Q69ZT1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fan1Q69ZT1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Fan1Q69ZT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Fan1Q69ZT1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Fan1Q69ZT1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms