Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PnkdQ69ZP3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PnkdQ69ZP3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PnkdQ69ZP3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PnkdQ69ZP3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PnkdQ69ZP3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PnkdQ69ZP3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms