Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kiaa1549Q68FD9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Kiaa1549Q68FD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kiaa1549Q68FD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kiaa1549Q68FD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kiaa1549Q68FD9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kiaa1549Q68FD9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms