Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hist2h2beQ64524 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hist2h2beQ64524 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hist2h2beQ64524 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hist2h2beQ64524 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hist2h2beQ64524 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms