Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pou4f3Q63955 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pou4f3Q63955 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pou4f3Q63955 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pou4f3Q63955 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou4f3Q63955 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou4f3Q63955 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 269.2 ms