Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Vil1Q62468 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29,21■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Vil1Q62468 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Vil1Q62468 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29,13■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Vil1Q62468 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29,07■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29,03■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Vil1Q62468 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,01■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,97■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Vil1Q62468 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28,92■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Vil1Q62468 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28,85■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Vil1Q62468 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms