Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TrhQ62361 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TrhQ62361 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TrhQ62361 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TrhQ62361 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TrhQ62361 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TrhQ62361 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TrhQ62361 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TrhQ62361 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TrhQ62361 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TrhQ62361 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TrhQ62361 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TrhQ62361 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TrhQ62361 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TrhQ62361 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TrhQ62361 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TrhQ62361 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TrhQ62361 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TrhQ62361 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TrhQ62361 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TrhQ62361 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TrhQ62361 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TrhQ62361 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124 ms