Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SypQ62277 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SypQ62277 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SypQ62277 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SypQ62277 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SypQ62277 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SypQ62277 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SypQ62277 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SypQ62277 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SypQ62277 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SypQ62277 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SypQ62277 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SypQ62277 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SypQ62277 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SypQ62277 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SypQ62277 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SypQ62277 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SypQ62277 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SypQ62277 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SypQ62277 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SypQ62277 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SypQ62277 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SypQ62277 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SypQ62277 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SypQ62277 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SypQ62277 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SypQ62277 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SypQ62277 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SypQ62277 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SypQ62277 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SypQ62277 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SypQ62277 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SypQ62277 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SypQ62277 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SypQ62277 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SypQ62277 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SypQ62277 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SypQ62277 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SypQ62277 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SypQ62277 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SypQ62277 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SypQ62277 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SypQ62277 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SypQ62277 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SypQ62277 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SypQ62277 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SypQ62277 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SypQ62277 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SypQ62277 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SypQ62277 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SypQ62277 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SypQ62277 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SypQ62277 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SypQ62277 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SypQ62277 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SypQ62277 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SypQ62277 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SypQ62277 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SypQ62277 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SypQ62277 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SypQ62277 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SypQ62277 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SypQ62277 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SypQ62277 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SypQ62277 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SypQ62277 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SypQ62277 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SypQ62277 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SypQ62277 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SypQ62277 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SypQ62277 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SypQ62277 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SypQ62277 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SypQ62277 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SypQ62277 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SypQ62277 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SypQ62277 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SypQ62277 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SypQ62277 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SypQ62277 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SypQ62277 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SypQ62277 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SypQ62277 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SypQ62277 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SypQ62277 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SypQ62277 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SypQ62277 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SypQ62277 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SypQ62277 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SypQ62277 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SypQ62277 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SypQ62277 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SypQ62277 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms