Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Six2Q62232 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Six2Q62232 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Six2Q62232 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Six2Q62232 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Six2Q62232 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Six2Q62232 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Six2Q62232 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Six2Q62232 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Six2Q62232 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Six2Q62232 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Six2Q62232 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Six2Q62232 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Six2Q62232 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Six2Q62232 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six2Q62232 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Six2Q62232 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Six2Q62232 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Six2Q62232 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Six2Q62232 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six2Q62232 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Six2Q62232 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Six2Q62232 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Six2Q62232 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Six2Q62232 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Six2Q62232 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms