Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scn9aQ62205 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scn9aQ62205 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Scn9aQ62205 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Scn9aQ62205 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Scn9aQ62205 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Scn9aQ62205 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scn9aQ62205 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Scn9aQ62205 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Scn9aQ62205 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Scn9aQ62205 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms