Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ctr9Q62018 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ctr9Q62018 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ctr9Q62018 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ctr9Q62018 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ctr9Q62018 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ctr9Q62018 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctr9Q62018 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctr9Q62018 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ctr9Q62018 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ctr9Q62018 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ctr9Q62018 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ctr9Q62018 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctr9Q62018 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctr9Q62018 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctr9Q62018 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ctr9Q62018 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms