Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pacsin1Q61644 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pacsin1Q61644 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pacsin1Q61644 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pacsin1Q61644 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pacsin1Q61644 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pacsin1Q61644 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pacsin1Q61644 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pacsin1Q61644 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
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