Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EsrrbQ61539 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EsrrbQ61539 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EsrrbQ61539 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EsrrbQ61539 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EsrrbQ61539 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EsrrbQ61539 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.9 ms