Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acvr1bQ61271 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acvr1bQ61271 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acvr1bQ61271 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Acvr1bQ61271 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acvr1bQ61271 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acvr1bQ61271 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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