Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hif1aQ61221 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hif1aQ61221 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hif1aQ61221 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hif1aQ61221 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hif1aQ61221 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hif1aQ61221 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms