Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tsg101Q61187 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tsg101Q61187 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tsg101Q61187 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tsg101Q61187 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tsg101Q61187 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tsg101Q61187 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tsg101Q61187 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms