Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf235Q61116 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Znf235Q61116 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Znf235Q61116 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Znf235Q61116 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Znf235Q61116 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf235Q61116 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Znf235Q61116 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Znf235Q61116 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf235Q61116 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf235Q61116 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf235Q61116 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf235Q61116 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf235Q61116 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf235Q61116 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms