Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncor1Q60974 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncor1Q60974 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncor1Q60974 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ncor1Q60974 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ncor1Q60974 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ncor1Q60974 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ncor1Q60974 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncor1Q60974 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ncor1Q60974 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ncor1Q60974 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms