Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Grik1Q60934 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Grik1Q60934 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Grik1Q60934 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Grik1Q60934 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Grik1Q60934 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik1Q60934 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms