Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30,18■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30,15■■■□□ 2,42
HellsQ60848 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
HellsQ60848 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
HellsQ60848 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30,09■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
HellsQ60848 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
HellsQ60848 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30,05■■■□□ 2,4
HellsQ60848 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30,03■■■□□ 2,4
HellsQ60848 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
HellsQ60848 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29,98■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
HellsQ60848 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
HellsQ60848 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,93■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29,93■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
HellsQ60848 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
HellsQ60848 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
HellsQ60848 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
HellsQ60848 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29,9■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29,89■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
HellsQ60848 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
HellsQ60848 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,88■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,88■■■□□ 2,37
HellsQ60848 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29,86■■■□□ 2,37
HellsQ60848 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
HellsQ60848 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
HellsQ60848 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
HellsQ60848 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,36
HellsQ60848 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
HellsQ60848 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29,74■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
HellsQ60848 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
HellsQ60848 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,3 ms