Protein–RNA interactions for Protein: Q60848

Hells, Lymphocyte-specific helicase, mousemouse

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HellsQ60848 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HellsQ60848 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HellsQ60848 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HellsQ60848 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HellsQ60848 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HellsQ60848 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HellsQ60848 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
HellsQ60848 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HellsQ60848 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HellsQ60848 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HellsQ60848 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
HellsQ60848 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HellsQ60848 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HellsQ60848 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HellsQ60848 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HellsQ60848 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HellsQ60848 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HellsQ60848 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HellsQ60848 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HellsQ60848 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HellsQ60848 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HellsQ60848 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HellsQ60848 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HellsQ60848 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HellsQ60848 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HellsQ60848 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms