Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Samhd1Q60710 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Samhd1Q60710 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Samhd1Q60710 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Samhd1Q60710 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Samhd1Q60710 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Samhd1Q60710 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Samhd1Q60710 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Samhd1Q60710 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms