Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rnf123Q5XPI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rnf123Q5XPI3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rnf123Q5XPI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rnf123Q5XPI3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rnf123Q5XPI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rnf123Q5XPI3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf123Q5XPI3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf123Q5XPI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rnf123Q5XPI3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf123Q5XPI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rnf123Q5XPI3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Rnf123Q5XPI3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms